Marcos A. Aidukaitis nasceu em Porto Alegre, Brasil, aos 30 de agosto de 1959. Casou-se com Luisa Englert em 1986. Eles são pais de cinco filhos. Ele licenciou-se em Engenharia Mecânica com especialização em Matemática pela Universidade de Brigham Young em 1988. Em 1989, concluiu um mestrado em Administração de Empresas pela Universidade de Brigham Young.
Marcos A. Aidukaitis serviu em vários chamados na Igreja, incluindo o de missionário de tempo integral na Missão Brasil São Paulo, sumo conselheiro, agente regional de bem-estar, presidente de estaca, presidente de missão e Setenta de Área.
Na época de seu chamado como Setenta Autoridade Geral, o Élder Marcos A. Aidukaitis servia como presidente da Missão Brasil Brasília. Ele serviu como membro do Quarto Quórum dos Setenta na Área Brasil Sul, de 2000 a 2005 e como membro da Presidência da Área América do Sul, Sul de 2008 a 2012. De 2012 a 2014, serviu como Diretor Executivo
Adjunto no Departamento Missionário e como assistente de área das Áreas América do Norte Noroeste e América do Norte Oeste.
Ele serviu como Presidente da Área Brasil, de agosto de 2017 a agosto de 2020. Na época de seu chamado como membro da Presidência da Área África Austral, ele servia na sede da Igreja como membro da Presidência da Área América do Norte Sudeste. Antes de seu chamado como presidente de missão, ele trabalhou como gerente geral de uma empresa multinacional no Brasil. Ele também foi sócio de uma empresa de negócios.